Managing NGS differential expression uncertainty with fuzzy sets

Abstract

When the reads obtained from high-throughput sequencing are mapped against a reference database, some of them - known as multireads - can map to more than one reference sequence. This event occurs because genomes contains many repeated portions and reads are generally shorter than reference sequences. Removing the multireads from the mapping results causes an underestimation of the read counts, while estimating the real read count can lead to false positives during the detection of differentially expressed sequences.


Tutti gli autori

  • A. Consiglio; C. Mencar; G. Grillo; S. Liuni

Titolo volume/Rivista

Non Disponibile


Anno di pubblicazione

2015

ISSN

Non Disponibile

ISBN

9788890643798


Numero di citazioni Wos

Nessuna citazione

Ultimo Aggiornamento Citazioni

Non Disponibile


Numero di citazioni Scopus

Non Disponibile

Ultimo Aggiornamento Citazioni

Non Disponibile


Settori ERC

Non Disponibile

Codici ASJC

Non Disponibile